サノスとの激闘でトニー・スタークを亡くしたピーター・パーカーは、そのショックから立ち直れずにいた。そんな中、夏休みの科学史ツアーに参加して同級生とヨーロッパへ旅立つ。ピーターはこの旅行を利用して、片想い中の女子MJとの距離を縮めようと画策していた。すると最初の目的地ヴェネツィアで水を操る怪物が出現。ピーターが応戦するも苦戦していたところ、マント姿のヒーロー“ミステリオ”が現れて怪物を撃退する。