あの超偏屈な問題医が帰ってくる！言葉や態度が悪いのは相変わらず！しかし、彼にもちょっとした変化が･･･？小学校の保健室で言葉にできないSOSと向き合ってきた小児科医・牧野が今度は中学校、そして、病院にいる子どもたちとも再び向き合う。中学校という新しい環境に馴染めずにいた元6年2組の藤野一希は、父親が突然新しい母と妹を連れてきたこともあり、家庭での居場所も失っていた･･･。一方、心臓病の手術を無事に終えた冴島直明は2年生に進級し、「牧野先生みたいなお医者さんになる」と語るが、新たな不安も抱えていた･･･。そんな中、病院にいる牧野のもとに病気が再発し、生きる意味を見出せなくなった少女・神谷愛莉がやってくる。病気だけではなく心も見ないといけないと、学校で知ったはずの牧野だが･･･。新たな困難にぶつかる子どもたち。牧野は彼らの言葉にできないSOSにどのように向き合うのか−−−−。