田舎町に住む元CIAエージェントのフランクは、恋人サラと平穏な生活を送ろうとしていた。そんなある日、かつての仲間マーヴィンが突然現れ、再び危険が迫っていることを告げる。すると間もなく、諜報機関に狙われてしまう。冷戦時代に開発され行方不明となった核爆弾「ナイトシェード」の生みの親ベイリー博士との関与を示す文書がネットに流出したことが原因だった。博士を探すフランクたちに、世界一の殺し屋ハンが送られる。