空に謎の三日月型の島を見つけたのび太は「あれこそ僕が探していたユートピアだ！」と言い張り、ドラえもんたちと一緒にひみつ道具の飛行船＜タイムツェッペリン＞で、その島を探しに出かけることに！色々な時代・場所を探してやっと見つけたその正体は、誰もがパーフェクトになれる夢のような楽園＜パラダピア＞だった！そしてそこで出会ったのは、何もかも完璧なパーフェクトネコ型ロボット・ソーニャ。すっかり仲良くなったドラえもんたちとソーニャだったが、どうやらこの楽園には大きな秘密が隠されているようで･･･。はたしてのび太たちは、その楽園の謎を解き明かすことができるのか！？