ヴァチカンでローマ教皇が逝去し、次の教皇選挙（コンクラーベ）が行われることに。その頃、スイスの研究機関で驚異的なエネルギーを持つ”反物質”の生成に成功するが、何者かに盗み出されてしまう。そんな中、大昔に消滅したはずの秘密結社イルミナティによって次期教皇の有力候補４人が拉致され、処刑の予告が届く。ヴァチカン警察から協力を求められた宗教象徴学者ラングドン教授は、数々の謎を解きながら事件の解決に挑む。