2021年にTBS日曜劇場枠で放送されたドラマ『TOKYO MER〜走る緊急救命室〜』の劇場版第2作。ドラマでは、鈴木亮平演じる医師・喜多見幸太が、「待っているだけじゃ、助けられない命がある」という信念のもと、切迫した状況でも常に冷静沈着にメンバーを引っ張り、どんな苦境にも飛び込んでいく姿が大きな感動を呼んだ。さらに、2023年4月に公開された劇場版第1作も大ヒットを記録。その続編である本作では、数多の命を救ってきたMERメンバーが大海原を舞台にした史上最大のミッションに挑むことに。沖縄・鹿児島にまたがる海に浮かぶ島々を巡る“南海MER”が誕生し、メンバーが医療の行き届かない離島医療に従事する中、とある火山島で大規模な噴火が発生し、全島民79名が命の危機に陥る。喜多見は、そして新しいMERメンバーたちは、果たしてすべての命を救うことが出来るのか？あの医療従事者（ヒーロー）たちの熱き戦いが、再び始まる。