五人の少年少女による特殊チーム「科学忍者隊」と、世界征服を企む悪の組織「ギャラクター」の地球の命運を賭けた戦いを描く。勧善懲悪のヒーロー作品である一方、公害や紛争といった社会問題や、友情、家族愛など重厚な人間ドラマを展開し、幅広い年齢層のファンを獲得したＳＦアクション。